六年窖头曲和头曲的区别在于其发酵时间和糟料的质量：

1. 发酵时间不同。六年窖头曲是经过六年以上的长时间发酵而成，发酵程度更深，口感更为浓郁。而头曲则是经过一年左右的发酵时间而成。

2. 糟料的质量不同。六年窖头曲的糟料是用优质大豆、小麦、糯米等配以优质产区的食用高粱，经过多次浸泡、磨捣、发酵而成。而头曲则以小麦为主要原料，辅以豆类杂粮，糟料的质量不如六年窖头曲。

总之，六年窖头曲相对于头曲来说更加精制和复杂，口感更加浓郁且陈年更长，因此价格也更高一些。