吴裕泰总店是品牌的旗舰店，位于品牌创始地台湾台北市，规模较大，店内的产品种类和数量都会比较全面，经常会有新品推出。此外，总店也有健康茶饮或餐饮配套服务，可供顾客享用。

分店则是吴裕泰在各地开设的门店，通常规模不如总店大，但也会提供品牌的经典茶饮和小吃。分店一般会针对当地的顾客需求进行调整和优化，比如口味地域化、特别套餐等。同时，分店的价格一般也会比总店更加亲民一些。