金边龙舌兰在生长期间会开花，花期一般在春季至夏季。其花序为高大的穗状花序，分布在植株顶端或分支处。花序开放后会散发出浓郁的香气，吸引蜂类等昆虫授粉。花朵多为黄色或绿黄色，形状为钟状，较为小巧。开花后，果实将逐渐成熟并变为褐色蒴果，内含数颗种子。