潮汕功夫茶只放三个杯子的原因是出于传统习惯和礼仪。三个杯子分别代表茶师、主人和客人。茶师先品尝茶的味道和品质，然后递给主人尝一口，主人再传给客人。这种传统的喝茶方式注重尊重客人和礼仪，让客人感受到主人的热情和关心，同时也体现了茶文化中的“以茶会友”的精神。