黑苦荞麦壳和普通荞麦壳的主要区别在于颜色和质地。黑苦荞麦壳是从黑苦荞麦籽中提炼而来，呈深棕色或黑色，质地较硬，比普通荞麦壳更加坚硬耐用。

普通荞麦壳则是从普通荞麦中提炼而来，呈浅棕色或淡黄色，质地相对柔软，常用于填充枕头、靠垫等家居用品。

此外，黑苦荞麦壳和普通荞麦壳在保暖性、通风性、吸湿性等方面存在一定的差异。因此在不同的使用场景下，选择适合的荞麦壳填充材料能够获得更好的效果。