沼气发酵的原理是指在缺氧条件下，利用微生物将有机物质（如畜禽粪便、农业废弃物、食品厨余废弃物等）分解为沼气和有机肥料的过程。这是一种复杂的微生物发酵过程，主要有以下几个阶段：

1. 酸化阶段：有机物质被一些酸化菌分解，产生有机酸和低碳酸气。

2. 乙酸菌阶段：在有机酸的作用下，乙酸菌对其进行进一步分解，产生乙酸和氢气。

3. 甲烷菌阶段：在乙酸和氢气的作用下，甲烷菌将其转化为甲烷和二氧化碳。

最终，产生的甲烷和二氧化碳混合在一起就形成了沼气。同时，沼液也是沼气发酵的产物之一，其中含有丰富的有机肥料成分，可以用来作为农业肥料，促进植物生长。