毛慈菇种子能繁殖能出来苗。不过它的种子比较细小，且休眠期比较长，因此在自然条件下是很难打破休眠期的，要经过催芽处理才行。它的种壳也比较硬，通透性差，对繁殖技术要求较高，成苗床率相比块茎繁殖的要低很多。所以在平时的生产过程中一般不会用种子进行繁殖。