1、小鼠的染色体多为端着丝粒染色体(17、18 对染色体为亚端部) ，呈“V”字形或“U”字形。由于重叠较多，数目难以数清。

2、各品系小鼠染色体C带大小存在多态性，亦即各近交系小鼠的某些对同一号染色体C带大小不同，可作为襄别近交系小鼠以及遗传监测的一种细胞一遗传学指标。