黄玉髓和黄水晶是两种不同的宝石，它们之间有以下几个区别：

1. 化学成分：黄玉髓是由二氧化硅（SiO2）和少量铁元素组成的微晶质石英，而黄水晶也是由二氧化硅（SiO2）构成的，但没有铁元素。

2. 颜色：黄玉髓的颜色以浅黄色为主，可能带有白色、灰色或棕色的斑点，而黄水晶则具有明亮纯净的黄色，很少有斑点。

3.硬度：黄玉髓的硬度在莫氏硬度尺度上为7，而黄水晶的硬度更高，为7.5。

4. 透明度：黄水晶通常具有高度的透明度，可以透光，而黄玉髓则通常是半透明的，不如黄水晶透明。

5. 获得方式：黄玉髓通常以晶洞或地下矿脉的形式存在，因此较难获得，而黄水晶则相对较常见，容易获得。

综上所述，黄水晶是一种具有高透明度、明亮纯净黄色的宝石，而黄玉髓更常见，色泽较浅，常常带有白色、灰色或棕色斑点。