1、本质区别：檀香为檀香科植物的心材。沉香是沉香树的一种香脂和木质成分的固体凝聚物。2、珍贵度区别：檀香比较常见。沉香很稀少。3、味道区别：檀香的香味典雅。沉香的香气更为悠扬绵厚。4、价格区别：檀香的价格稍低。沉香的价格居高。5、功效区别：檀香具有理气、和胃的功效。沉香具有行气止痛、纳气平喘的功效。
一、本质区别
1、檀香：檀香为檀香科植物的心材，具有重要的药用价值，分布于印度、马来西亚、澳大利亚、印度尼西亚等地，中国台湾也有栽培。
2、沉香：沉香实际上是沉香树的一种香脂和木质成分的固体凝聚物，沉香树在自然界中被虫子咬、风吹断枝、雷击等原因树干受损后被真菌侵入寄生，在菌体内酶的作用下，侵蚀朽化使木材的薄壁细胞贮存的淀粉，产生一系列变化，形成香脂，最后经多年乃至千年的沉积形成了有香脂和木质成分的固态凝聚物。
二、珍贵度区别
1、檀香：檀香比较常见，檀香有黄檀、小叶紫檀、红檀、黑檀、绿檀等。
2、沉香：沉香很稀少，越南将沉香列为国宝，禁止出口，所以越来越少见到。沉香根据形成环境分为土沉、水沉、蚁沉、倒架等，原材又以奇楠为好，当然好的沉香不仅价值连城，而且数量极少。
三、味道区别
1、檀香：檀香的香味典雅，闻起来可以凝神静气，多为宗教所喜，现在市场上也有檀香的精油，涂抹在物件上就会散发出浓郁的香气。
2、沉香：沉香的香气更为悠扬绵厚，并且香气较之檀香不同。
四、价格区别
1、檀香：檀香的价格稍低，还要看是不是真檀的，紫檀和香檀不同，价格也是不同的。
2、沉香：沉香的价格居高，上好的材料只有小小一块，而价格不好说的，因为其稀少，所以每年的价格都是不同的。
五、功效区别
1、檀香：檀香味辛，性温，无毒，入脾、胃、肺经，具有理气、和胃的功效，治心腹疼痛、噎膈呕吐、胸膈不舒等症。
2、沉香：沉香味辛、苦，性微温，归脾、胃、肾经，具有行气止痛、温中止呕、纳气平喘的功效，治胸腹胀闷疼痛、胃寒呕吐呃逆、肾虚气逆喘急等症。
