一、为亲友非法牟利罪由谁侦查?

为亲友非法牟利罪由公安机关侦查处理，侦查机关，是指在刑事诉讼活动中，享有国家赋予的侦查权，并对犯罪案件依法进行侦查的专门机关。我国的侦查机关主要是指公安机关、国家安全机关、人民检察院、军队保卫部门、中国海警局和监狱侦查部门以及海关走私犯罪侦查机关等。侦查机关作为侦查活动的主体，在打击犯罪活动中发挥至关重要的作用。绝大多数刑事案件发生后，往往都是侦查机关首先介入其中，并开展侦查工作。因此，国家设立侦查机关并通过其活动可以及时预防、制止、揭露、证实犯罪，维护国家、集体利益和公民的合法权益，维护国家的稳定、社会的安定和经济的发展。

二、为亲友非法牟利罪与贪污罪的界限

一方面，应当考察非法获利者(即亲友)是否实施了一定的经营行为。对于在国有单位的购销活动中通过实施一定的经营行为牟取非法利润的行为，一般可以依法认定为为亲友非法牟利罪;反之，对于借从事经营活动之名，行侵占公共财物之实的行为，则可以考虑依法认定贪污罪。

另一方面，还应当考察非法获利者(即亲友)所取得的是否属于实施经营行为的“利润”。在司法实践中，有些非法获利者也实施了一定的经营行为，如在国有单位的购销活动中参与实施了介绍货源或商品买家等行为，但其从国有单位所获取的已绝非从事经营行为之“利润”或从事中介活动之“报酬”，其非法所得与行为时的相应市价或报酬水平显著背离，以致达到了社会一般观念普遍不能认同为“利润”或“报酬”的程度。

概言之，为亲友非法牟利罪以上述国有单位人员利用职务便利让亲友实施一定的经营行为赚取非法利润为特点;相对而言，贪污罪则以国有单位人员利用职务便利直接让亲友非法占有公共财物为特征。与此相应，为亲友非法牟利罪的罪质主要表现为侵犯市场经济的正当竞争秩序和国家利益;贪污罪的罪质则主要表现为侵犯公共财物的所有权。

对于为亲友非法牟利罪的认定和处理，是需要严格基于上述法律中规定的不同条件和情况来进行处理的，特别是不同的涉案事实所认定的处罚标准是不同的， 如果对相关事项的处理不清楚的，可以咨询律师来进行合法的界定。