商标权人单独起诉销售者的诉讼存在程序合法性的争议分歧是：
1、销售者侵权行为的独立性。
2、从知识产权请求权的角度，知识产权权利人有权选择自己认为合适的对象进行诉讼。
3、销售者与其他环节的商标侵权人不是必要共同诉讼人。
4、销售者侵权案的生效判决对其他环节商标侵权人的预决性问题。
侵犯商标权纠纷的处理办法有：
1、自行协商。如果双方能在侵权行为发生之后和解，则既可以使商标权人迅速有效地实现和维护自己的权益，也可以使侵权人避免声誉的损害。不愿意协商或者协商不成，当事人可以直接向法院提起民事诉讼。
2、调解。调解不是解决著作权纠纷的必经程序，当事人愿意调解、达不成调解协议或调解后反悔的，都可以直接向法院起诉。
【法律依据】
《中华人民共和国商标法》第五十七条，有下列行为之一的，均属侵犯注册商标专用权：
(一)未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标的;
(二)未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标近似的商标，或者在类似商品上使用与其注册商标相同或者近似的商标，容易导致混淆的;
(三)销售侵犯注册商标专用权的商品的;
(四)伪造、擅自制造他人注册商标标识或者销售伪造、擅自制造的注册商标标识的;
(五)未经商标注册人同意，更换其注册商标并将该更换商标的商品又投入市场的;
(六)故意为侵犯他人商标专用权行为提供便利条件，帮助他人实施侵犯商标专用权行为的;
(七)给他人的注册商标专用权造成其他损害的。
