更改土地使用证应由用地者填写变更土地登记申请书，说明变更依据和变更内容，同时提供证明材料；根据土地变更登记申请的内容项目进行实地调查审核权属并进行地籍测量；审核通过后更换土地证书。
更换土地证流程是：
1、办好房权证后，需带身份证、房产证、原土地证、合同、房屋过户的契税发票等材料原件及复印件，到当地土地管理部门申请测绘、评估，出具测绘图和评估报告。
2、带着测绘图和评估报告到当地土地管理部门受理窗口申请办理。
3、因办房权证已经缴纳契税等费用，只需缴纳登记费(工本费)即可。
【法律依据】
《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四条，农民集体所有的土地，由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。设区的市人民政府可以对市辖区内农民集体所有的土地实行统一登记。
