辞退员工补偿代缴个税是需要申报的，国家规定了对劳动者取得的一次性经济补偿金和赔偿金征收个人所得税的最低标准，只有超过该标准的数额，再按照劳动者在用人单位工作的实际年限进行平均后，才向劳动者征收个人所得税。具体标准如下：

(一)以当地上年职工平均工资3倍数额为标准，低于该数额的，劳动者无需缴纳个人所得税;高于该数额的，劳动者需要缴纳个人所得税。

(二)劳动者取得的一次性经济补偿金等收入高于当地上年职工平均工资3倍的，用高出的数额除以劳动者在用人单位的工作年限(劳动者在用人单位的工作年限超过12年的，按照12年计算)，所得数额视为劳动者个人的月工资或薪金收入，对该数额超过2000元的部分征收个人所得税。