与诉讼方式比较起来，医患双方协商和解医疗纠纷的优势体现在几个方面。
1、成本低廉、效率较高。协商通常是医患双方直接商谈，不存在第三方，所以在协商过程中双方容易找到对医疗行为、医疗结果及其原因认识的分歧点和解决纷争的关节点，从而快捷地解决争议，节省双方通过诉讼方式解决争议所需要的大量的精力和财力。
2、可以在很大程度上消弥因医疗纠纷所产生的医患对立，为医患双方提供了相互理解和谅解的机会。
3、有利于节约有限的司法资源，促进社会稳定。然而协商和解医疗纠纷的上述优势要充分发挥有一个重要的前提，即医患双方遵守法律规定，理性地、友好地进行协商。但在现实当中，协商和解医疗纠纷已经成为医患双方的无奈，随着协商和解越来越多，其弊端也日益显现。
二、申请卫生行政部门处理
当事人申请卫生行政部门处理的，由医疗机构所在地的县级人民政府卫生行政部门受理。医疗机构所在地是直辖市的，由医疗机构所在地的区、县人民政府卫生行政部门受理。
三、向提讼
向提讼是当事人在遇到医疗纠纷是最后的选择。通过对案情的客观分析与看待，公正的处理医院与当事人双方之间的矛盾，这是解决医疗纠纷的最后防线。
