1、存储的原理不同：U盘是以半导体材料(芯片)作为存储单元,又叫固体存储器,没有机械部分。移动硬盘则是以磁性介质作为存储器,有机械部分。

2、主控算法不同：硬盘采用的是一种特殊的算法，这个算法每个厂家都不一样，而且是封装在主控芯片里的。而U盘不是这样。

3、容量差别大：目前U盘常见的在1G-32G,现在最大的有128G的，但比较移动硬盘小了很多，但随着制造技术的进步，U盘的容量将会突飞猛进出现新的发展。