犯本条所规定之罪的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑或者无期徒刑。情节严重一般是指担任重要职务的人叛逃的，携带国家秘密叛逃的，叛逃后发表有损中华人民共和国的言论的，等等。
掌握国家秘密的国家工作人员犯本罪的，依照上述规定从重处罚。
根据《中华人民共和国刑法》第５６条和第１１３条的规定，犯本罪的，应当附加剥夺政治权利，可以并处没收财产。
二、叛逃罪是如何认定的
（一）叛逃罪与背家罪的区别
叛逃罪表现为叛逃境外或在境外叛逃，也具有的性质，但是叛逃罪与背家罪有很大的区别，主要表现在：
第
一，犯罪主体不同。本罪的主体必须是国家机关工作人员；而背家罪的主体只要是跨国公民即可。
第
二，在客观方面有所不同。本罪的客观行为表现为在履行公务期间叛逃境外或者在境外叛逃，危害中华人民共和国国家安全和行为；而背家罪则表现为勾结外国，危害中华人民共和国的主权、领土完整和安全的行为。
（二）叛逃罪与军人叛逃罪的区别
主体不同。一个是国家机关工作人员；一个是军人。
（三）叛逃罪与偷越国（边）境的区别
犯罪目的不同，主体身份不同。犯叛逃罪与偷越国（边）境的，属于吸收犯。
（四）叛逃罪与投敌叛变罪的区别
所谓投敌叛变罪，是指投奔敌人营垒并为其效劳，或者在被捕、被 俘后，敌人的行为。投敌叛变罪、叛逃罪都具有的性质，但是二者却有本质的区别，主要表现在：
第
一，犯罪主体不同。本罪只能是国家机关工作人员；而投敌叛变罪的主体是中国公民。
第
二，在客观方面不同。本罪表现为在履行公务期间，叛逃境外或者在境外叛逃的行为；投敌叛变罪则表现为投奔敌人营垒或者敌人的行为。二者区别的关键是本罪只是叛逃到境外，却不是投靠敌人；而投敌叛变罪则主要是投靠敌人，并有变节行为，却不一定是投奔境外的敌人。
