分居期间，夫妻双方婚姻关系还未解除，因此所还贷款部分为夫妻共同债务。债权人就婚姻关系存续期间，夫妻一方以个人名义所负债务主张权利的，应当按夫妻共同债务处理。
但夫妻一方能够证明债权人与债务人明确约定为个人债务的除外。对于夫妻共同债务应当由共同财产进行偿还。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十九条，离婚时，夫妻共同债务应当共同偿还。共同财产不足清偿或者财产归各自所有的，由双方协议清偿；协议不成的，由人民法院判决。